2001年 “代办股份转让系统”（即“老三板”）成立。“老三板”的出现是为了解决主板退市企业的问题以及原STAQ、NET系统内存在的法人股历史遗留问题。但“老三板”由于挂牌的股票品种少，多数质量较低，且挂牌企业转板难度大，因此长期被冷落。

     为了改变我国场外市场的落后局面，同时为更多高科技成长型企业提供股份流动的机会，2006年初新的股份转让系统在北京中关村科技园区建立，被称为“新三板”。

     2012年8月3日，经国务院批准，决定扩大非上市股份公司股份转让试点，按照“总体规划，分步推进，稳妥实施”的原则，设立全国中小企业股份转让系统。首批扩大试点中，新增上海张江高新技术产业开发区、武汉东湖新技术产业开发区、天津滨海高新区，连同北京中关村科技园区形成了初步的新三板市场格局。

     2013年1月16日，全国中小企业股份转让系统在北京正式揭牌运营（因称呼习惯的延续，转让系统仍被称为“新三板”），为发展全国性的场外市场奠定了基础。

     2013年6月19日，国务院总理李克强主持召开国务院常务会议，会议确定了加快发展多层次资本市场的多项政策，包括将中小企业股份转让系统试点扩大至全国，鼓励创新、创业型中小企业融资发展。此次会议确定了将新三板试点直接扩展到全国的方案，不但突破了区域的限制，也突破了“国家级科技园区”的限制。

     新三板市场是经国务院批准设立的全国性证券交易场所。企业在新三板市场挂牌的条件较低，企业只需满足“设立满2年，业务明确，具有持续经营能力，治理机构健全，股权明晰，股票发行和转让行为合法合规”等基本条件即可申请在新三板挂牌。新三板对挂牌企业没有明确的财务指标要求。新三板市场将成为面向全国中小型成长企业的融资平台，有利于从整体上促进我国中小企业的发展以及我国资本市场的不断完善。